Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm38215-201ENSMUST00000192321 2233 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Orai2-202ENSMUST00000196454 3990 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Crat-203ENSMUST00000102855 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rapgef6-203ENSMUST00000102743 8189 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pan2-201ENSMUST00000005825 4445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms