Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms