Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms