Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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