Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms