Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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