Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Kif23-201ENSMUST00000034815 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ufl1-202ENSMUST00000102994 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ccnc-202ENSMUST00000102997 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pacsin3Q99JB8 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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