Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pcx-204ENSMUST00000224726 4034 ntAPPRIS P3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Srp54b-201ENSMUST00000164243 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm15455-201ENSMUST00000117459 2557 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Stambp-201ENSMUST00000068054 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm18981-201ENSMUST00000185373 1599 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm38383-201ENSMUST00000194131 2660 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cnbd2-203ENSMUST00000109580 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms