Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Syne3Q4FZC9 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Syne3Q4FZC9 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne3Q4FZC9 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Syne3Q4FZC9 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Syne3Q4FZC9 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Syne3Q4FZC9 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne3Q4FZC9 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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