Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms