Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Sh3bp1P55194 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Sh3bp1P55194 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Sh3bp1P55194 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1P55194 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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