Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms