Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Acox2-201ENSMUST00000022271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Spag8-201ENSMUST00000084646 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ankdd1b-201ENSMUST00000055607 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Sorbs2-228ENSMUST00000153798 2667 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12436-201ENSMUST00000131099 2959 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms