Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pole2O54956 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms