Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Smarcd2Q99JR8 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Smarcd2Q99JR8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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