Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms