Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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