Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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