Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms