Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp72F8VQC1 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp72F8VQC1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp72F8VQC1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp72F8VQC1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp72F8VQC1 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Srp72F8VQC1 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Srp72F8VQC1 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Srp72F8VQC1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Srp72F8VQC1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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