Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms