Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gtf3c6Q9D8P7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gtf3c6Q9D8P7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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