Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms