Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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