Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm6298-201ENSMUST00000122262 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm43225-201ENSMUST00000201381 1439 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm46992-201ENSMUST00000222120 1389 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 2010009K17Rik-201ENSMUST00000186977 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm8689-201ENSMUST00000218709 712 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 AC124687.4-201ENSMUST00000222361 463 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Psen1-202ENSMUST00000101225 3023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Alg13-203ENSMUST00000123710 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm45538-201ENSMUST00000210771 1061 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Olfr1264-201ENSMUST00000099758 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Olfr323-203ENSMUST00000214132 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm22659-201ENSMUST00000104195 130 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm11605-201ENSMUST00000120413 646 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm37804-201ENSMUST00000192206 547 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm13178-201ENSMUST00000036876 1227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm43290-201ENSMUST00000200359 1557 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Cphx3-201ENSMUST00000163305 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm4798-201ENSMUST00000218024 1699 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Tnni2-201ENSMUST00000105971 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms