Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms