Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Syncrip-211ENSMUST00000174688 3176 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tmem181b-ps-202ENSMUST00000180035 2426 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Mpp2-202ENSMUST00000100398 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Osbpl3-203ENSMUST00000114466 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Drosha-207ENSMUST00000169061 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm10741-201ENSMUST00000218151 1748 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Hsd17b13-201ENSMUST00000048118 1708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AC122197.1-201ENSMUST00000220281 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Opn1sw-201ENSMUST00000080428 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Sec14l3-201ENSMUST00000068322 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm26700-201ENSMUST00000181480 1957 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Nox1-202ENSMUST00000113275 1694 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm17090-201ENSMUST00000171768 490 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Bank1-203ENSMUST00000196159 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Tdrd3-205ENSMUST00000170865 2530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Smok3c-201ENSMUST00000110967 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Tgfb1i1-204ENSMUST00000164710 3788 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ccdc120-201ENSMUST00000033490 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Grk2-201ENSMUST00000025791 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ncald-201ENSMUST00000090150 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Slc25a30-201ENSMUST00000022580 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 9330154K18Rik-201ENSMUST00000176703 2104 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Lif-201ENSMUST00000040750 3798 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm38012-201ENSMUST00000193022 3029 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ubap2l-220ENSMUST00000199834 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gng7-201ENSMUST00000092285 3362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 4930526F13Rik-201ENSMUST00000144718 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms