Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tdrd6P61407 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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