Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Sh3bp1P55194 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms