Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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