Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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