Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm17577J3QNF7 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms