Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms