Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ces2b-201ENSMUST00000059449 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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