Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ciao1Q99KN2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms