Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Card11Q8CIS0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms