Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms