Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Prpf31-206ENSMUST00000179769 3125 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Disp2-203ENSMUST00000110843 2949 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm43795-201ENSMUST00000202051 2366 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Aldoart1-201ENSMUST00000078617 2052 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a9-201ENSMUST00000032703 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms