Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Otud5Q3U2S4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms