Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rpusd2Q149F1 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rpusd2Q149F1 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms