Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm6073-201ENSMUST00000198253 466 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Tmprss11d-201ENSMUST00000031175 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gzmb-201ENSMUST00000015581 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm29388-201ENSMUST00000190718 284 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 AC140406.3-201ENSMUST00000227619 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Ly6g6e-202ENSMUST00000172494 464 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 1810011H11Rik-202ENSMUST00000227060 496 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm16299-201ENSMUST00000162724 2766 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Olfr1343-ps1-201ENSMUST00000117414 914 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Mrgpra3-201ENSMUST00000176369 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 AC113178.1-201ENSMUST00000227616 935 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Rnf219-204ENSMUST00000228448 1056 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Zmym6-202ENSMUST00000094713 3922 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm12257-201ENSMUST00000148244 585 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Zfp185-203ENSMUST00000164800 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms