Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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Rpl28P41105 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Rpl28P41105 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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