Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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