Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms