Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Usf3B2RUQ2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms