Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zbed5B2RPU8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zbed5B2RPU8 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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