Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl4Q9DCU6 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms