Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms