Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ccdc187Q8C5V8 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ccdc187Q8C5V8 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ccdc187Q8C5V8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc187Q8C5V8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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