Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rad54bQ6PFE3 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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